بخشهای کتابخانه عبارتند از :

امانت
پایان نامه
فهرست نویسی
نرم افزارها (CD, Ebook)
ثبت و آماده سازی 
سالن مطالعه خواهران و برادران

بخش امانت

پویایی هر کتابخانه مستلزم ارائه خدمات مناسب، مداوم و روزآمد است. تمام فعالیت‌های کتابخانه در جهت ارائه خدمات به استفاده کنندگان کتابخانه است و بیشترین تبلور آن در بخش امانت می‌باشد. در کتابخانه دانشکده پزشکی این بخش با استفاده از نرم افزار پارس‌آذرخش امکان استفاده از منابع موجود را برای مراجعه کنندگان فراهم می سازد .

‌ ساعت کاری این بخش از ساعت 00: 8 الی 14:45 می‌باشد .

بخش پایان‌نامه                                                                      

   در این بخش پایان‌نامه های کلیه فارغ التحصیلان دانشکده پزشکی اهوازاعم از دوره دکترای عمومی، تخصصی، فوق تخصصی، PHDو کارشناسی‌ارشد نگهداری می‌شود. به منظور رعایت امانت، تهیه زیراکس از پایان‌نامه مجاز نیست و به طور کلی پایان‌نامه‌ها از بخش مربوطه خارج نمی‌شوند. استفاده از پایان‌نامه‌ها صرفا با حضور اعضای کتابخانه در بخش مذکور امکان‌پذیر است.

 ساعت کاری این بخش از ساعت 00: 8 الی 14:45 می‌باشد .

بخش فهرست نویسی
در این بخش کلیه کتابهای فارسی و لاتین در نرم افزار پارس آذرخش کتابخانه فهرستنویسی می شوند. همچنین کتابهای وجین شده که از رده خارج می شوند در این بخش از مجموعه کتابخانه در نرم افزار خارج می شود .

ساعت کاری این بخش از ساعت 8:00 الی 14:45 می‌باشد .

 بخش نرم افزارها  

مجموعه مواد الکترونیکی در کتابخانه های دانشگاهی از اهمیت فراوانی برخوردار است و در بسیاری از مراکز آموزشی و پژوهشی به عنوان وسیله کمک آموزشی کاربرد فراوان دارند و به دلیل استفاده از متن و تصویر در انتقال و درک مطالب آموزشی بسیار موثرند. نیز از آنها در فعالیتهای پژوهشی جهت مستند ساختن فرایند پژوهش و آموزش استفاده می شود .

 امانت نرم افزارها  با ارائه کارت عضویت و  حداکثر به مدت یک روز می باشد.
ساعت کاری این بخش از ساعت 8:00 الی 14:45 می‌باشد

بخش ثبت و آماده سازی 
در این بخش کلیه کتابهای فارسی و لاتین و همچنین CD های کتابهای فارسی و لاتین ثبت وآماده سازی می شود.آماده سازی شامل ثبت، زدن برچسبهای عطف و جیب کتابها و CD ها  می باشد . همچنین صحافی کتابهای فرسوده در این بخش انجام می شود.

ساعت کاری این بخش از ساعت 8:00 الی 14:45 می‌باشد.

سالن مطالعه :

سالن مطالعه خواهران و برادران در دو سالن مجزا ازبخش امانت می باشد و ساعت کاری این بخش  از ساعت 7:30 الی 18 می باشد.